税務調査の現場から

みなさま、こんにちわ。年末年始いかがお過ごしでしたでしょうか？
私は年末調整に追われて四苦八苦しております。これが終わると法定調書、そして2月からは楽しい、楽しい確定申告が始まります。こんな忙しい中で2月27日に法人会の仕事を手配してくれた部長には吐き気がするくらい感謝してます。きっとメチャクチャ嫌われているんだと思います。（いずれ勝負をつけてやる。）

　さて年末調整は、よく「サラリーマンの確定申告」と言われるように普段、給与から天引きされている個々の社員の源泉税の支払い及び精算を会社が行なう行為です。これの趣旨は、本来個人の所得税を計算するのは確定申告を行なうのが原則ですが、社員に代わって会社が計算して税金を支払うというものです。きっと税務署の都合でできた制度だと思います。
　それで、この源泉税。税務署が会社を調査するときによく狙ってくるところではあります。たとえば、こんな会話は税務調査の現場ではよく聞くものです。

税務署職員「なぜ、社員の給与の源泉税をお支払いしていないのですか？」
社長「社員の要望で全額渡しにしているんです。彼らは自分で確定申告しているというのでそれを信用しました。」
税務署職員「しかし、源泉税を支払うのはルールなのでお支払いくださるよう手続きいたします。」
社長「待ってください。社員は確定申告をして確かに払っているんですよ！」
税務署職員「それはわかってます。」

というわけでここで問題となります。

問題：税務署職員は社員が税金を払っていることを知りながら、会社に源泉税を支払わせるよう手続きをとろうとしています。これはあるルールがあるためなのですが、一体それはどんなルールでしょう。